虽然法规在产品开发中有时被视为不怎么让人愉悦的元素，但法规能造就或毁掉一种配料、一种产品，甚至是整个行业。对创新的新配料而言，在美国的法规内运作将充满挑战。而当公司在多个国家经营时，这个挑战会成指数级增长。
未能确定一个食物的所有配料是否均符合当地法规的后果会很严重。“该产品将被海关扣留或者可能需要被销毁，”国际监管数据库公司Decernis的资深科学家 Carolyn Fisher说。
“目前有一种缓慢而稳定的趋势，那就是法规的区域性协调，如欧盟、南美南方共同市场以及白俄罗斯、哈萨克斯坦和俄罗斯形成的欧亚经济联盟。然而，了解需要什么是费时的，”她补充道。法规有许多不同的形式和语言，并且解释起来非常困难。
Fisher说，虽然益生菌是在许多食物中天然存在的生物，但在添加到食品或饮料中之前，它们也必须确保是安全的。该生物体的种类和在食品基质中的代谢副产物必须是已知的。此外，如果制作健康声称，疗效证明是必要的。
近年来，一家凭借其创新型益生菌制造新闻的公司已经学会了成功驾驭国际监管领域。Ganeden Biotech报告其GanedenBC30已获得在六大洲的60多个国家的监管部门的批准，来年，将有更多的国家有望给予支持。
赞同 Fisher的言论的Ganeden高级副总裁Mike Bush指出，每个国家都有自己的监管指引。一种配料获得批准需要大量投入，有些人可能在数周内获得，而有些则需要数年。
GanedenBC30已经获得美国药典（USP）专著的帮助，Bush解释说。“在其他国家，益生菌获得批准的一般过程是，首先需要我们提交安全数据以及我们因自我肯定的GRAS决定而接收到的FDA无异议函。”然后提交美国药典专著。“这通常足以让我们获得批准，”他补充道。
健康声称的认证已更具有挑战性。欧洲食品安全局（EFSA）驳回了数百份已提交的益生菌健康声称。有些国家甚至不准许使用术语“益生菌”，因为它意味着对健康有好处。EFSA允许每份至少含有“10⁸CFU活的微生物（如德氏乳杆菌保加利亚亚种和嗜热链球菌）”的酸奶/发酵牛奶产品（专为乳糖消化不良的人而设计）进行健康声称。
杜邦公司最近大举进入非欧盟国家瑞士，因为它对其Howaru乳双歧杆菌HN019宣布了声称。通过在一家大型瑞士杂货连锁店的工作，全国联邦食品安全和兽医办公室（FSVO）将允许关于益生菌通过减少食物通过肠道的时间来支持消化能力的陈述。
其他国家发布了与经许可益生菌相关的声称，包括加拿大和日本。在日本，声称是基于产品基础的和FOSHU系统下的特定声称。美国还没有公布其获得批准的声称清单。
许多讨论是围绕对一般益生菌的声称是否合理或它们是否是菌株特异性的。6月，国际科学协会益生菌和益生元国际科学协会在网上公布了使用术语“益生菌”（http://ow.ly/yyp
该声明表明特定的健康益处在被研究的益生菌中可能普遍存在。这样的好处包括例如“摄动微生物的正常化”以及酸和短链脂肪酸的生成。其它益处可能经常在最益生菌菌株中观察到，如维生素合成和“致癌物质的中和。”最后，可能有更为罕见的益处，如免疫学、神经病学和内分泌学效果，这些是特异性菌株。
益生菌微生物会在健康的生活方式和应对疾病上越来越重要。规范它们的使用和声称将是断断续续的。
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