联合国粮食及农业组织认为，有机食品生产通过建立农业的良性生态系统，取代了化肥、作物保护剂、清洗用品和添加物等外部农业投入。

1960年代，Rachel Carson 在其经典著作《寂静的春天》中生动地描述了杀虫剂 DDT 是如何破坏环境的。最终，DDT在 1972年被禁止使用。自此，完全不使用杀虫剂的有机耕种方式在全球逐渐得到更广泛的应用。

近年来，有机食品的热度有增无减。越来越多的餐厅、商店都开始供应贴有“有机”标签的食品、饮料和农副产品。

据美国有机农业研究基金会数据，2014年，美国有机食品部门销售额达到 55亿美元，而 2008年，该数据仅为 32亿美元。

但这些数据不代表着所有人都接受了有机食品的概念。支持者认为，购买有机食品有助于环境和身体健康。反对者认为，这些好处言过其实。美国网站 Business Insider 最近对食品生产的“有机”和“非有机”方式进行了全方面的解析，详情如下：

化肥、杀虫剂等化学添加剂

有机耕种不允许使用化学肥料、杀虫剂、添加剂和辐照（用辐射照射食品杀害病菌）等。但由于没有了添加剂，作物的生长过程会变得更缓慢，也无法阻止昆虫和作物感染病。DDT 刚开始被禁用的时候，有些农民十分沮丧，因为 DDT 可用的植株种类较广，能有效解决全球的粮食短缺问题。若不使用农药，作物颗粒会比普通的小。

研究表明，喷洒至经济作物的农药中，仅 1%能有效杀灭害虫，剩下 99%的化学物质则会渗入环境。同时，60%的除草剂、90%的杀菌剂，及 30%的杀虫剂可能致癌。最终，这些物质不仅是进入环境，还会进入饮用水。美国玉米生产带和 Chesapeake Bay 超过 1400万以上人口喝的水，都被农田径流废水所污染。全美国 90%以上的水源都被至少一种杀虫剂所污染。

农药还会导致哺乳动物荷尔蒙失调。因为农药可以模拟雌激素，抑制其它性激素，科学家发现部分雄性的鱼内会产生卵细胞，还有一些短吻鳄、乌龟和青蛙也出现过。

众多有机耕种的支持者指出，墨西哥湾的“死亡地带”就是最大的受害者之一：农药中的磷和氮流入密西西比河，然后流至墨西哥湾，因此，引发大面积的赤潮和水中含氧量锐减，没有生物可在当地的水中存活。不过，也有研究表明，大部分的致癌物质都源自“作物为驱赶捕食者而生产的毒素”，而非合成农药。

即便一位农民已经通过了有机认证，也很少会因为“偶尔”使用农药和化肥受到惩罚，有机标准如何严格执行始终是一个大问题。

生产效率和成本问题

据美国农业部（USDA）制定的有机食品标准，肉牛每年至少要在牧场放养 120天。牧场饲养让肉牛更多富含 omega-3脂肪酸的瘦肉。而非有机饲养的肉牛则是挤在室内，终年不见天日。为了经过有机认证，在生产小牛之前，农场必须全年保持这样的状态，这会导致农场主不堪重负。

有机牛肉还不能使用任何抗生素和激素。按照传统农业中，抗生素改变牛的荷尔蒙作用方式，令其体重加速增长。然而，早在几十年前，农场主就广泛使用抗生素提高产量和利润，不使用抗生素的话，饲养肉牛的成本要高得多。

传统耕作和有机耕作都依赖拖拉机，使用的石油燃料会增大温室气体的排放量，对环境造成伤害，但传统耕种使用拖拉机播撒氮肥，比有机耕作产生更多的温室气体排放和污染。不过，部分研究表明，有机农田的石油燃料使用量仅比传统耕作少 4%，也就是说，差距微乎其微。

传统耕作使用的氮肥效果明显，播撒后能立即生效。有机耕种不行，使用的产品需要分解，起作用前要先被土壤吸收。相较于传统农田，有机农田每单位面积产生的碳和氮排放更低。

有机生产作物产量低。平均来说，有机农场的产量为传统农场的 75%。也就是说，生产等量的作物，有机生产需要更多的土地。因需要更集约的土地管理，更多的劳作时间和较低的产量，有机产品的价格也更高。

虽然有机生产有益于生态环境，不过很多人认为，因为有机耕作需要更多的土地，使用更多的机器，导致更高的碳排放，最终促使气候变化。